NetCDFデータを処理するツール Climate Data Operators cdo-1.9.8 を Ubuntu 19.10 にてインストールする

準備
　CDOソース
　　CDO開発プロジェクト(Max-Planck研究所)のページ
　　　https://code.mpimet.mpg.de/projects/cdo
　　ダウンロード cdo-1.9.8.tar.gz (10MB)
　　　https://code.mpimet.mpg.de/attachments/20826/cdo-1.9.8.tar.gz
　ecCodes - GRIB, GRIB2, BUFR3, BUFR4 の形式のバイナリを扱うためのライブラリ
　　開発者ページ（ECMWF）
　　　https://confluence.ecmwf.int//display/ECC/ecCodes+Home
　　ダウンロード eccodes-2.14.1-Source.tar.gz (10.5MB)
　　　https://confluence.ecmwf.int/download/attachments/45757960/eccodes-2.14.1-Source.tar.gz?api=v2
　Magics - 描画に必要なライブラリ
　　開発者ページ（ECMWF）
　　　https://confluence.ecmwf.int//display/MAGP/Magics
　　ダウンロード Magics-4.2.0-Source.tar.gz (67MB)
　　　https://confluence.ecmwf.int/download/attachments/3473464/Magics-4.2.0-Source.tar.gz?api=v2
　その他Ubuntuパッケージ
　　cmake libnetcdf-dev libnetcdff-dev libnetcdf-c++4-dev libcairo2-dev libpango1.0-dev libproj-dev libboost-dev hdf5-tools hdf5-helpers libhdf5-dev libhdf5-doc libhdf5-serial-dev
　その他pythonパッケージ（python2）
　　jinja2

ecCodesのビルド
　ソース展開と作業ディレクトリ作成
　　tar xvfz eccodes-2.14.1-Source.tar.gz
    mkdir build
    cd build

　コンフィグレーション
　　cmake ../eccodes-2.14.1-Source -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/usr/local -DCMAKE_C_COMPILER=gcc -DCMAKE_Fortran_COMPILER=gfortran

　メーク, テスト, インストール
　　make
　　ctest
　　sudo make install

Magicsのビルド
　ソース展開と作業ディレクトリ作成
　　tar xvfz Magics-4.2.0-Source.tar.gz
    mkdir build
    cd build

　コンフィグレーション
　　sudo pip install jinja2
　　cmake ../Magics-4.2.0-Source -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/usr/local -DCMAKE_C_COMPILER=gcc -DCMAKE_Fortran_COMPILER=gfortran

　メーク, テスト, インストール
　　make
　　ctest
　　sudo make install

CDOのビルド
　ソース展開
　　tar xvfz cdo-1.9.8.tar.gz
　　cd cdo-1.9.8

　コンフィグレーション
　　CFLAGS=-I/usr/include/hdf5/serial \
    CXXFLAGS=-I/usr/include/hdf5/serial \
    LDFLAGS=-L/usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial \
    FC=gfortran F77=gfortran \
    ./configure --prefix=/usr/local \
      --with-fftw3 --with-magics=/usr/local --with-eccodes=/usr/local \
      --with-netcdf --with-hdf5

　メーク, インストール
　　make
　　sudo make install

daigo@ocg.aori.u-tokyo.ac.jp